دستگاه ایمنی یا سیستم ایمنی ( فرانسه : Système immunitaire ) بخشی از بدن است که سلول‌ها و مولکول‌های خودی را از بیگانه مثل میکروب ها شناسایی میکند و آنهارا از بین می برد یا بی‌خطر می کند. گاهی به دلیل تشابه آنتی‌ژن، سلول‌های خودی با غیرخودی سیستم ایمنی به سلول‌های خودی حمله می‌کند. (بیماری‌های خودایمنی ) نگاره‌ای از یک نوتروفیل (نوعی گلبول سفید واقع در سمت راست عکس) در حال فاگوسیتوز و یا خوردن باکتری سیاه‌زخم که با میکروسکوپ الکترونی گرفته شده‌است.

هنگام هر حرکت مجموعه اعمال پیچیده و منظمی انجام می گیرد تا منجر به حرکت شود. مثلاً هنگامی که راه می‌رویم یا چیزی را با دست می‌گیریم، چندین ماهیچه، عصب و بخش‌های دیگر شرکت دارند. حتی زمانی که فقط ایستاده‌ایم، ماهیچه‌های زیادی در حال فعالیت هستند. فعال‌ترین ماهیچه‌های بدن، ماهیچه‌های چشم هستند که حدوداً بیش از صد هزار بار در روز حرکت می‌کنند. هر حرکتی در ماهیچه ‌ناشی از انقباض ماهیچه‌ است که بر اثر تحریک عصبی انجام می شود.